發放最低工資標準不會再扣除社保，應發放的最低工資標準是已經扣除社保。工資低于最低工資標準的可以向當地勞動保障監督機構投訴或者向勞動爭議仲裁機構申請仲裁。
一、發放最低工資標準還會扣除社保嗎
發放最低工資標準不會扣除社保，社保由公司從個人月工資中扣除，如果應發工資（扣除社保前的工資）不低于當地最低工資標準就是合法的。友情提示，《最低工資規定》第五條，最低工資標準一般采取月最低工資標準和小時最低工資標準的形式。月最低工資標準適用于全日制就業勞動者，小時最低工資標準適用于非全日制就業勞動者。
第六條，確定和調整月最低工資標準，應參考當地就業者及其贍養人口的最低生活費用、城鎮居民消費價格指數、職工個人繳納的社會保險費和住房公積金、職工平均工資、經濟發展水平、就業狀況等因素。
確定和調整小時最低工資標準，應在頒布的月最低工資標準的基礎上，考慮單位應繳納的基本養老保險費和基本醫療保險費因素，同時還應適當考慮非全日制勞動者在工作穩定性、勞動條件和勞動強度、福利等方面與全日制就業人員之間的差異。
月最低工資標準和小時最低工資標準具體測算方法見附件。
二、工資低于最低工資標準怎么辦
工資低于最低工資標準的處理：如果發現自己的工資低于當地最低工資標準，可以向當地勞動保障監督機構投訴，也可以向當地勞動爭議仲裁機構申請仲裁，維護自己的合法權益。
根據《最低工資條例》，在勞動者提供正常勞動的情況下，用人單位應支付給勞動者的工資不得低于當地最低工資標準：
（一）延長工作時間工資；
（二）中班、夜班、高溫、低溫、井下、有毒有害等特殊工作環境，條件下的津貼；
（三）法律、法規和國家規定的勞動者福利待遇。
三、什么是最低工資，適用于哪些情況
最低工資指勞動者在法定工作時間提供了正常勞動的前提下，其用人單位支付的最低金額的勞動報酬。
適用情況：
1.雙方當事人約定的勞動者在未完成勞動定額或承包任務的情況下；
2.試用、熟練、見習期間，在法定工作時間內提供了正常勞動；
3.企業下崗待工人員和女職工因生育、哺乳請長假而下崗的；
4.職工患病或非因工負傷治療期間。


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